Magnífico monumento de estilo románico-primitivo comenzado a principios del siglo XI y terminado en el siglo XII.
San Isidoro fue fundado para servir de mausoleo a San Isidoro de Sevilla. Destaca por la fuerza expresiva de su concepción.

El cuerpo del templo es románico, gótica la cabecera y renacentista la cornisa.

Fue edificada, sobre un templo prerrománico, en 1055 por Fernando I El Magno (1037-1065) y su esposa doña Sancha.

Consta de una planta en forma de cruz latina con tres naves de seis tramos y tres ábsides y crucero con dos soberbios arcos polilobulados de influencias hispanomusulmanas. Posee bóveda de cañón en la nave central y de aristas en las laterales. Novedad estructural en su construcción fue el empleo de bóvedas bajas de arista sobre las naves menores que permiten iluminar con grandes ventanales la nave mayor. Hermosos capiteles rematan las columnas.

En El Panteón de los Reyes (1054 y 1067), están enterrados 23 reyes leoneses.
Tiene también tres naves con columnas monolíticas de mármol y magníficos capiteles.
Esta decorado con pinturas al fresco con temas sobre la vida de Jesús y escenas de la vida diaria del siglo XIII. Debido al gran valor de sus frescos recibe el nombre de "la capilla sixtina" del Arte Románico.

El Museo guarda una colección de antiquísimos manuscritos. Se conservan muy diversos objetos de inestimable valor artístico, y en su biblioteca hay valiosísimas obras: Bíblias, incunables, códices, etc.

Tiene dos portadas características del arte románico: la del Cordero que representa el sacrificio de Abraham y la del Perdón con el descendimiento de la Cruz. La Iglesia tenuemente iluminada en su interior, es un lugar de recogimiento muy apreciado por los leoneses.