En general, la vegetación en la Comunidad de Madrid es de tipo mediterráneo.
Abundan la encina, coscoja, madroño, romero y tomillo, entre otras especies, aunque en alturas superiores a 1.200 m. crece el pino silvestre, el roble, el castaño y el acebo. En las cumbres hay prados naturales y enebros.

La vegetación en La Pedriza es muy variada.
Va desde alcornoques y encinas a pinos (silvestre, negral, laricio y piñonero), pasando por matorrales de acebos, zarzas, jaras, espinos y madroños.

La vegetación se estratifica en función de la altitud:
EN LA CUENCA FLUVIAL DEL MANZANARES se situan los bosques de ribera con sauces, chopos, fresnos, abedules y sauces salgueros principalmente.

EN LAS ZONAS BAJAS, en las proximidades del nucleo urbano de Manzanares el Real, abundan los prados, fresnedas y dehesas.

EN LAS ZONAS DE MEDIA MONTAÑA se desarrollan los matorrales autoctonos representados por las jaras, mejoranas, brezos y encinas.

EN LAS ZONAS DE ALTA MONTAÑA la gayuba forma extensas alfombras verdes en las umbrías. El frío intenso y la falta de agua condicionan la vegetación de esta cumbres. Abundan tan sólo el enebro rastrero y el piorno de flores amarillas que sobreviven en un suelo de pura roca.

Las REPOBLACIONES realizadas por el ICONA a mitad del siglo XX se realizaron principalmente con coniferas como el pino negral, pino silvestre, pino laricio, ciprés y arizónica.

En las zonas muy deterioradas y erosionadas las repoblaciones son imprescindibles. Para ello se eligen especies resistentes que comiencen a formar suelo y detengan el proceso erosivo, antes de instaurar la vegetación natural de la zona.